화학생물공학부 학생회는 2006년 3월 30일 출범하였다. 학생회는 기본적으로 학생들의 학교생활에 불편한 점을 같이 의논하고 개선 시켜 나가는 것을 기본으로 하며, 학생들 간의 화합의 장을 마련하고, 교수님과 학생간의 의사소통의 통로로서 그 역할을 수행하고 있다.

학생회의 구성으로는 학생회장과 부회장이 있고 그 아래로 수평적으로는 각 정규학번 학번대표들과 비정규학번 대표가, 수직적으로는 각 반 학생회장과 각 반 과대표들로 구성되어 있다. 내부조직으로 집행부, 기획부, 총무부, 홍보부가 있어서 학부활동에 관심이 있는 일반 학부생들도 학생회에 참여하여 함께 일하고 있다. 학생회 회의는 기본적으로 한달에 한번 하는 것을 원칙으로 하고 공식 행사진행이 있는 달에는 특별회의를 열어 행사 진행에 대해 토의하게 된다. 회의에는 회장, 부회장과 학번대표, 반 학생회장과 과대표들, 그리고 각 부서 부장들이 참여하여 진행된다. 이 외에도 화학생물공학부 학부생이라면 자유롭게 참여하여 의견을 낼 수 있도록 하여 열린 학생회를 지향하고 있다.